福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所（简称质标所），于2016年1月6日由原“福建省农业科学院中心实验室”（成立于1983年）根据省委编办（闽委编办〔2016〕4号文件）批复更名，并分别向福建省技术监督局、中国合格评定国家认可委等相关机构更名备案。 质标所为隶属福建省农业科学院的独立法人单位，对外承担法律责任和义务，是完全独立的第三方公正检验机构。主要职责是以应用基础研究和应用研究为主，开展农产品质量安全、农业质量标准与检测技术研究，承担农产品的质量评价、安全限量、农业标准研究与制订修订、质量安全风险评估与管理、质量控制监管技术对策研究、检测技术与方法研究以及测试服务等，承担农产品质量、安全、标准和检测技术中的重大科技问题研究。
质标所实行创新研究体系和检测技术服务体系双重管理模式。 创新研究体系设置农产品质量与安全检测技术研究室、农产品质量安全风险评估研究室、健康养殖与饲料质量安全研究室、农业生物安全研究室、农业质量标准与信息化研究室等5个研究室。检测技术服务体系设置业务室、质量室、技术室、检测室（下设药物添加物检测组、金属元素检测组、营养与常规检测组、微生物检测组、电镜检测组）、财务室、科管室等6个职能部门。质标所现有在职职工45人，其中专业检测技术人员34人，占职工总数的75.56%；博士6人，硕士15人；高级职称技术人员12人。形成了一支多学科、高学历的科技人才队伍。
质标所配套设施完备齐全，仪器设备先进完善。建筑面积1500m2，实验室面积900m2，固定资产1800多万元。现有透射电子显微镜、扫描电子显微镜、氨基酸自动分析仪、三重四极杆气相质谱仪、气相色谱仪、高效液相色谱仪、电感耦合等离子发射光谱仪、石墨炉原子吸收光谱仪、原子荧光光谱仪等检测设备100多台（套），其中大型进口精密设备20台（套），总价值达1000多万元。质标所连续两年在福建省科技厅开展的大型科学仪器设备协作共用服务绩效考核中取得佳绩，获入网成员单位绩效考核二等奖，同时氨基酸自动分析仪获大型科学仪器入网仪器一等奖，扫描电子显微镜获二等奖，高效液相色谱仪获三等奖。
质标所于1989年获福建省科学技术厅批准，设立 “福建省精密仪器农业测试重点公共实验室”；1991年经福建省质量技术监督局授权，设立“福建省水产饲料质量监督检验站”，并获得省级检验机构计量认证（CMA）资质；2007年获得国家认可实验室（CNAS）资质；2011年被授予农业部农产品质量安全风险评估实验室。多年来，质标所在农业部、福建省科技厅、福建省财政厅等相关部门的大力支持下，逐步配备了各种大型精密分析仪器，引进专业技术人才，不断完善管理制度和运行机制，建立了不同领域的检测技术和方法，不仅为农业、水产饲料等行业提供了优质的分析测试服务，还为全省各类高校、科研院所、企事业单位的重点攻关课题提供了大量的测试数据和分析结果。
