江苏里下河地区农业科学研究所，又名扬州市农业科学研究院，隶属江苏省农科院和扬州市委、市政府双重领导，座落于扬州市蜀冈—瘦西湖国家级风景名胜景区，1949年4月创建。数十年来，经过几代科技人员的共同努力，现已发展成为研究力量较强、学科优势突出、区域特色明显的综合性农业科研机构。
目前拥有中国工程院院士1名，在职研究员28名，副研究员37名，“333人才工程”培养对象11名，有突出贡献的中青年专家31名，博士生25名、硕士生49名，12人享受政府特殊津贴，3名专家分别当选全国人大代表和全国政协委员。
设有水稻、小麦、核技术应用、经济作物、资源与环境、应用微生物、植物保护等研究室，形成农作物育种和栽培、生态农业工程技术、辐照中心“三大”研发中心。投资设立江苏金土地种业有限公司、扬州绿源生物化工有限公司、扬州辐照中心等科技型企业。先后承建国家小麦改良中心扬州分中心、国家水稻改良中心南京分中心扬州试验站、农业部扬稻及扬麦原原种繁殖基地、国家农业综合开发江苏省优质杂交籼稻繁育推广中心、国家现代农业产业技术体系小麦育种与种子研究室和小麦沿海试验站、水稻扬州综合试验站、油菜扬州综合试验站、农业部长江中下游小麦生物学与遗传育种重点实验室、国家农副产品辐照保质基地、国家农业旅游示范基地、国家及江苏引智成果示范推广基地、中国农科院扬州稻麦试验站、江苏省小麦种质基因库、江苏省长江下游优质弱筋小麦原原种扩繁基地、江苏省生态农业工程技术研究中心等重大建设项目。建成占地900多亩的农业科研育种基地、占地30亩的江苏省生态农业工程技术研究中心和装源活度100万居里的扬州辐照中心。投资装备小麦品质实验室、稻麦分子育种实验室和生态农业技术实验室。
多年来，根据农业生产需求，在农作物育种、生态农业技术研究、核技术应用等领域创立自身优势和特色，先后育成农作物新品种132个，研制新产品、新技术90多项，制订发布各类农业标准117项，获植物新品种权55个、国家发明专利36项、科技成果奖206项。其中，“扬麦5号”、“扬麦158”获国家科技进步一等奖，“扬稻2号”获国家星火一等奖，“扬稻6号”、“BS—10”灭蚊幼获国家科技进步二等奖，“水晶辐照变色技术”获国家星火二等奖，“扬麦4号”、“扬稻4号”获国家科技进步三等奖，“扬麦16”获农业部中华农业科技奖一等奖。科技成果转化创社会经济效益500多亿元。
1985、1988、1996先后三次获省政府嘉奖。荣获全国科技成果推广先进集体、全国植物新品种保护先进集体等称号，多次得到省农科院和扬州市委市政府的表彰。在“十五”、“十一五”农业部对全国农业科研机构的科研、开发综合实力评估中，均获全国地市级农科所第一名。
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