云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所成立于2004年，是为适应现代农业科技发展需要和应对农产品质量安全科技与服务需求，由院内相关部门及课题组联合组建而成。主要职责是围绕建立全省农业质量标准、农产品质量安全及其相关的检测技术体系，开展农业质量标准、农产品质量安全、农业分析测试技术、植物新品种检测评价技术、农业标准化技术、农产品功能物质与加工技术等研究，为云南省农产品质量安全提供坚实的科技支撑。是国家无公害农产品定点监测中心、中国绿色食品定点监测中心、中国有机食品定点监测中心、农业部植物新品种DUS测试定点单位。农业部农产品质量监督检验测试中心（昆明）、农业部农产品质量安全与风险评估实验室（昆明）、农业部植物新品种测试（昆明）分中心挂靠我所建设。所内设3个管理机构，4个研究室，5个挂靠中心（实验室）。
研究所现有职工52人。已获省级以上各类科技奖15项，发明专利4项，制定颁布国家标准4项、行业标准28项，出版专著6部。
近年来，每年发表论文20余篇，发布标准3—5项，已成为云南省农产品质量安全的科技骨干力量。在2012年全国农业科研机构综合能力评估（2006—2010）中，成功进入全国百强，在全国1058所农业科研单位中总排名第83位，在全国农业标准检测专业研究所中排名第1位。
