广东省农业科学院农业资源与环境研究所前身是广东省农业科学院土壤肥料研究所，成立于1960年，为公益二类正处级科研机构，主要从事植物营养与作物高效施肥、农业资源利用与新型肥料研发、土壤改良与耕地保育、农业面源污染监测与治理、农田重金属污染土壤修复等领域的公益性科学研究和成果推广转化、技术服务工作。现有在职员工78人，其中高级职称27人，博士16人。建有“农业部南方植物营养与肥料重点实验室”、“广东省养分资源循环利用与耕地保育重点实验室”、“广东省新型肥料与高效施肥工程技术研究中心”、“广东省农业面源污染监测评估与防控工程技术研究中心”和“广州市城乡废弃物农用资源化工程技术研究中心”，牵头成立了广东省农业产地环境安全技术创新联盟。
“十二五”以来，承担各级科研项目150余项，其中主持公益性行业（农业）科研专项1项，国家自然科学基金7项，科技部星火计划项目2项，科技部亚非青年科学家来华工作项目1项，国际合作项目5项。获得科技成果奖励18项，其中农业部中华农业科技奖一等奖2项，教育部技术发明二等奖1项，广东省科学技术二等奖5项。发表科技论文近200余篇，SCI和EI收录35篇。获得授权专利43项，16个肥料产品取得产品登记证，其中4个获的国家肥料产品登记证。本所拥有连续流动分析仪、气质联用仪、气相色谱仪、离子色谱仪、注射分析仪、高效液相色谱仪、原子荧光-高效液相联用仪、原子荧光分光光度计、原子吸收分光光度计、总碳/氮分析仪、荧光定量PCR、超低温冰箱、超声波细胞破碎仪、自动凯氏定氮仪及微波消解系统等先进的科研仪器设备，完善的管理制度，具有开展农业及相关领域研究的充足条件。
研究所在保持土壤与肥料的传统研究基础上，开展农业环境污染控制与修复、农业资源高效利用等领域的应用基础研究、应用研究和技术集成，并开展农业与现代化技术交叉领域探索研究，进一步推动科技创新与服务三农的紧密结合，为学科发展和产业升级提供技术支撑。
