漳州市农业科学研究所创建于1958年，是漳州唯一市级、公益型农业综合科研机构。设有食用菌、水稻、蔬菜、植保和果树5个专业研究室，漳台农业种业、生物组培及花卉3个中心。现有人员60人，其中高级职称13人，中级职称17人，初级6人。目前拥有国家食用菌产业技术体系漳州综合试验站和农业部农药药效试验两个技术平台。
近年来，主要开展以下研究：食用菌（白背毛木耳、双孢蘑菇、草菇、杏鲍菇等）、蔬菜（苦瓜、豌豆、丝瓜、芥菜等）、果树（番石榴、葡萄、百香果等）、花卉（朱顶红、多肉植物等）、水稻等新品种选育；药用植物、花卉等组织培养及移栽技术；病虫害防控与农药生物测定。此外还开展农业“五新”技术推广与应用、“农友之声”热线咨询、现代休闲农业模式示范、科技扶贫等工作。
建所以来，荣获国家和部、省、地（市）级科技成果100多项，其中独立完成的“水稻新组合特优63选育”获国家科技进步三等奖。近五年来，获市级以上科技进步奖10项，其中省科技进步三等奖2项，市政府科技进步二等奖、三等奖8项。选育并通过省级审（认）定水稻、蔬菜、果树、食用菌等农作物新品种16个；获得国家发明专利和实用新型专利4项。还获得“全国农业科普先进单位”称号。
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