菏泽市种子管理站是菏泽市农业局直属单位。管理种子事宜，促进发展。农作物新品种区域试验；农作物种子品种管理、生产管理、质量管理、市场管理；农作物种执法体系建设及指导；农作物种子生产、经营许可证管理；种子发展规划编制实施；种子储备。
1、农作物区域试验
通过试验，鉴定主要农作物品种在我市的适应性，为品种通过国家或省级审定提供科学详实的试验数据。
2、品种管理
受农业主管部门委托对我市推广的品种监督管理，未经审定的品种不得发布广告，不得经营、推广。
3、生产管理
受农业主管部门委托负责对企业生产的主要农作物杂交种子及其亲本种子、常规种原种种子生产许可的审核，以及除上述种子以外的其他种子生产的行政许可。
4、质量管理
受农业行政主管部门委托，依据《种子法》和《农作物种子质量监督抽查管理办法》规定，负责对企业生产经营的农作物种子质量监督，并进行抽查，对抽查检查结果向社会公布。
5、市场管理
受农业主管部门委托依法对种子市场进行监督管理，打假抚优，维护种子生产者、经营者和使用者的合法权益。受理涉及种子质量的各种举报，对举报人保密。
6、农作物种执法体系建设及指导
依据《种子法》及国办发〔2006〕40号文件规定，负责农作物种执法体系建设及指导。
7、农作物种子生产、经营许可证管理
受农业主管部门委托对农作物生产经营许可证分类进行审核、审批。并依据《种子法》对伪造、变造、买卖、租借生产经营许可证等违法行为进行查处。
8、编制种子发展规划
根据我市土壤、气候、栽培等各项因素，从国家或省级审定品种中筛选适宜我市的农作物新品种，制定新品种的推广计划。
9、种子储备
种子管理站负责种子储备，并对储备的种子进行定期检验更新，用于发生自然灾害时的生产需要，保障农业生产安全。
