汉中市种子管理站是汉中市农业局下属的正处级参公事业单位，编制37人，主要承担全市种子执法管理和种子技术推广服务职能。领导职数为1正3副，内设党政办公室、财务后勤科、市场管理科、质量管理科、品种管理科、技术推广科等6个科室。
党政办公室：负责全站党务、政务日常工作及综合性文件的起草，落实党政联席会、站务会、支委会、站长办公会的决议和决定，做好工作的综合协调；组织职工开展政治、业务学习及各种集体活动；负责单位人事及离退休人员管理；负责单位文书处理及档案管理；负责精神文明建设、平安单位创建及社会治安综合治理工作；负责全市种业信息的收集、筛选整理及交换发布；承担《汉中种业信息》、《送阅件》的组稿、编辑及发行工作；负责《汉中种业信息网》的运行和维护等。
财务后勤科：负责单位财务、劳资管理；负责单位公共资产和车辆管理；承担设施、设备、职工劳保福利的采购和管理工作；负责单位后勤服务与综合协调；承担职工工资发放和住房公积金、医疗保险、养老保险办理等工作；组织科技项目申报和项目管理；负责计划生育及卫生单位创建等工作。
市场管理科：负责全市农作物种子生产、经营许可管理工作，对申请办理种子生产、经营许可证的条件进行复核；组织种子生产、经营市场检查，对违法行为按照委托职责依法进行查处；开展种子法律法规的宣传、组织及对种子执法人员、经营人员的培训和考核；承担涉种上访接待及种子纠纷调处工作；负责辖区种子企业管理工作。
品种管理科：负责全市农作物品种管理；组织农作物新品种引进、试验和筛选；承担品种区域试验的方案制定、组织实施及资料汇总分析等工作；完成市品种管理小组的日常工作，提出全市品种布局意见草案、报审品种推荐意见及不适宜种植品种退出建议。
质量管理科：负责全市农作物种子质量监督管理；接受农业行政主管部门委托，承担市场种子质量监督抽查检验及田间制种质量抽检；接受社会委托，进行种子质量检验及质量仲裁；
组织种子检验人员培训和考核。
技术推广科：负责种子生产新技术的引进、培训和推广；承担农作物新品种展示、示范观摩及推广工作；开展新品种配套高产栽培技术研究及产业化开发；负责良种补贴相关工作。
