农林科技学院是在原农学系和园林系的基础上，经过整合，2006年6月组建成立的二级教学学院，其发展历史可追溯到1949年8月成立的陇东农林科技试验站、五十年代更名为庆阳地区农业科学研究所，1965年创建的庆阳地区农业干部培训学校、1975年更名为庆阳地区农业学校，1978年9月成立的庆阳师范高等专科学校生物系农学专业。
农林科技学院下设办公室，有农林基础、农学、园艺、资源环境、食品科学等五个教研室。建有生理生化、植物遗传、土壤肥料、微生物、土地资源与测绘、气候与生态、生物技术等7个专业基础实验室；耕作栽培、作物育种、昆虫病理等3个农学专业实验室；园艺作物栽培、园艺作物育种、组织培养等3个园艺专业实验室；地质地貌、环境监测、植物营养、地理信息等4个农业资源与环境专业实验室；食品加工、食品工艺、食品分析等3个食品科学与工程专业实验室。实验室面积4800多平方米。建有农业科技成果、昆虫标本、作物标本、岩石土壤等4个成果标本展馆。有高标准校内教学、科研、示范实验实习基地。有稳定的校外实践教学基地17个，校内示范性实践教学基地2个。学校的农业科学研究所在我院设立，下设6个研究室；“甘肃省农村人才教育培训基地”“甘肃省现代农业技术培训基地”、“庆阳市陇东冬小麦工程技术研究中心”、“庆阳市现代苹果工程技术中心”、“庆阳市第六职业技能鉴定所农林科技学院鉴定工作站”在我院设立。
农林科技学院现有教职工52名，其中教授（研究员）15人，副教授（副研究员、高级农艺师）19人，讲师（农艺师、助理研究员）12人。有博士7人，硕士27人；享受国务院特殊津贴1人，甘肃省第一批“333创新人才工程”1人，甘肃省第三批“555创新人才工程第二层次”3人，庆阳市“领军人才”1人，庆阳市“科技功臣”2人，庆阳市优秀科技工作者3人，庆阳市“185人才工程”5人。
农林科技学院现有农学、园艺、农业资源与环境、食品科学与工程等四个本科专业。农学专业培养具备坚实的生物科学、作物生产、作物遗传育种及种子生产与经营管理等方面知识，具备开展与农学有关的教学、科研、技术设计、推广开发、经营管理等方面的工作能力，具有健全人格及社会责任感，有创新、创造和敬业精神的农学学科复合型人才。园艺专业培养具有较完整的现代生物科学和园艺基本理论知识，熟练掌握园艺科学的基本技能，能在果树、蔬菜、观赏园艺、设施园艺、园林绿化及其他相关领域从事现代园艺生产、科技推广、产业开发、经营管理及科研等方面的工作，有较宽广的适应性和一定专业特长的园艺技术复合型人才。农业资源与环境专业培养适应社会主义现代化建设和社会发展需要，德、智、体等方面全面发展，具备农业资源与环境的基本理论、基本知识和基本技能, 能够进行农业资源与环境质量的定性与定量分析及评价，掌握提高水分、养分、土壤、生物等资源利用效率的技术与方法，具有利用信息技术实现对农业资源与环境的开发、利用与保护及退化防治等宏观管理与决策的能力，能在政府部门、农业管理部门、企事业、科研、教育和规划等单位从事农业资源与环境的保护、开发、管理等方面工作的农业资源与环境学科的高级人才。食品科学与工程专业培养具有良好的政治文化素质，具有外语及计算机应用的基本能力，系统掌握食品科学与工程领域的基本知识和基本技能，能在食品的生产、加工、流通及与食品科学与工程有关的教育、研究、进出口、卫生监督、安全管理等部门从事食品或相关产品的科学研究、技术开发、工程设计、生产管理、品质控制、产品销售、检验检疫、教育教学等方面工作，具有宽广知识面、多领域适应能力的食品科学与工程专门人才。
农林科技学院坚持贯彻党的教育方针，以应用型人才培养为根本任务，以学科建设为龙头，以本科教学为中心，重视科研工作；坚持以人为本，努力提高人才培养质量；以课程体系创新、内容更新和教学方法创新为重点，不断推进教学改革；以科技创新为动力，人才梯队建设及组织管理为保障，全面提高教学质量及学院的综合办学实力。
农林科技学院牢固树立“人才培养的质量是高等学校的生命线，提高教学质量是学院永恒的主题”的观念；坚持“教学科研型”办学定位。坚持“德育为首，教学为主，育人为本，服务三农，发挥优势，突出特色”的办学理念。坚持“立足陇东、面向西部、服务地方”；“以科研促教学，加强学科专业建设”；走“农科教结合，产学研一体化”，为区域经济服务的发展之路。
农林科技学院确立具有创新精神和实践能力的“基础实、能力强、素质高”的复合型应用型人才培养目标。整体优化教学内容和课程体系，以促进学生知识、能力、素质协调发展为基本要求。
农林科技学院为实现学校“转型、提升、发展”的战略目标，以全面提高教师队伍素质为核心、以培养优秀青年骨干教师为重点、以“双师型”教师培养为师资队伍建设目标，打造一支爱岗敬业、无私奉献的教师队伍。
根据以上培养目标和发展思路，我院提出的办学指导思想是：以人才培养为中心、学科建设为龙头、队伍建设为保障、科技创新为支撑、服务区域经济建设为目标，走“农科教结合，产学研一体化”特色办学之路。
多年来，农林科技学院在学科专业建设方面成绩突出，“作物遗传育种”被确定为省级重点学科；农学专业被确定为省级特色专业；《土壤肥料学》被评为省级精品课程。考研工作名列前茅，考研录取率和重点院校录取率不断上升。科研工作特色显明，截止2013年底，主持完成科研项目193项，有173项科研成果获市（厅）级以上奖励；编辑出版教材、专著15部，发表学术论文844篇，制定地方标准39部，申报专利3项。
学院先后邀请中国农科院、西北农林科技大学等科研院校专家教授举办学术报告会，开展交流合作。院内专家经常深入庆阳市各县区及周边地区开展“设施蔬菜栽培技术”、“冬小麦高产栽培技术”、“果树管理技术”等技术培训和科技指导。科技服务工作得到了当地政府和群众的一致好评。
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